MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 6074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013385	AGG	2	6	2092372	2092377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_013385	AGG	2	6	2092700	2092705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_013385	TTC	2	6	2092763	2092768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_013385	GA	3	6	2092800	2092805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_013385	AGG	2	6	2093868	2093873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_013385	TCA	2	6	2094092	2094097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_013385	C	6	6	2095833	2095838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6008	NC_013385	TCC	2	6	2095911	2095916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_013385	ACC	2	6	2095933	2095938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_013385	C	7	7	2095955	2095961	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6011	NC_013385	GCG	2	6	2095962	2095967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_013385	A	7	7	2096009	2096015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_013385	CTCC	2	8	2096037	2096044	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6014	NC_013385	GAAGG	2	10	2096057	2096066	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_013385	A	6	6	2096980	2096985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_013385	AGG	2	6	2096990	2096995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_013385	CTC	2	6	2098276	2098281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_013385	CTC	2	6	2100261	2100266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_013385	ACC	2	6	2100267	2100272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_013385	A	6	6	2100389	2100394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_013385	CCG	2	6	2103319	2103324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_013385	GAC	3	9	2103393	2103401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_013385	GCTT	2	8	2103402	2103409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_013385	T	6	6	2103426	2103431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_013385	G	6	6	2103508	2103513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_013385	AAAG	2	8	2111690	2111697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_013385	GCT	2	6	2112029	2112034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_013385	C	6	6	2112645	2112650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6029	NC_013385	C	7	7	2114276	2114282	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6030	NC_013385	GGA	2	6	2114430	2114435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_013385	TGC	2	6	2114446	2114451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_013385	CG	3	6	2114488	2114493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_013385	CTT	2	6	2114503	2114508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_013385	GA	3	6	2114647	2114652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_013385	GCCT	2	8	2114683	2114690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_013385	TC	3	6	2114729	2114734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_013385	CAT	2	6	2114744	2114749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_013385	T	6	6	2114749	2114754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013385	GA	3	6	2114772	2114777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_013385	TCGAG	2	10	2114823	2114832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6041	NC_013385	CTG	2	6	2115302	2115307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_013385	AGG	2	6	2115383	2115388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013385	TCC	2	6	2115400	2115405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_013385	GC	3	6	2115447	2115452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_013385	GA	3	6	2115530	2115535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_013385	TC	3	6	2115615	2115620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_013385	C	6	6	2115641	2115646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6048	NC_013385	CCT	2	6	2115721	2115726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_013385	CTA	2	6	2115759	2115764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_013385	CGC	2	6	2115779	2115784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_013385	A	6	6	2115808	2115813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_013385	CAC	2	6	2119866	2119871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_013385	TCCC	2	8	2120331	2120338	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6054	NC_013385	A	7	7	2120345	2120351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_013385	TCC	2	6	2120378	2120383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_013385	CCT	2	6	2120658	2120663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_013385	GTT	2	6	2121448	2121453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_013385	AG	3	6	2121482	2121487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_013385	CGC	2	6	2122322	2122327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_013385	TC	3	6	2122337	2122342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_013385	ACCG	2	8	2122348	2122355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_013385	ATGA	2	8	2122360	2122367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_013385	A	7	7	2122371	2122377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_013385	AGG	2	6	2122396	2122401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_013385	CTA	2	6	2123099	2123104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_013385	G	6	6	2123139	2123144	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_013385	ACC	2	6	2123191	2123196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_013385	CCG	2	6	2123213	2123218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_013385	GCC	2	6	2124387	2124392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_013385	CAT	2	6	2126385	2126390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_013385	TTCC	2	8	2126391	2126398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_013385	TCC	2	6	2127139	2127144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_013385	CGAG	2	8	2127167	2127174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_013385	TCC	2	6	2128511	2128516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.